农村厨房厕所的改造需要从多个方面进行，首先需要考虑的是通风和采光，确保厨房和厕所都有足够的通风设备和窗户，以保证空气流通和卫生。
其次，需要改善厕所的卫生条件，安装蹲便器或马桶，并做好防水和排水设施。厨房方面，可以考虑安装燃气或电热水器，改善烹饪条件。此外，厨房和厕所的地面和墙面也需要进行防水处理，并选择合适的材料进行装修。最后，要合理规划布局，确保使用便利和舒适。
农村厨房应该选择使用环保、无毒、无味、防水、防油、防霉的涂料。建议使用低挥发性有机溶剂、水性涂料或乳胶漆，这样可以保证安全卫生，防止污染，同时也为厨房墙壁和天花板提供了很好的保护。
在选择涂料时，应注意其牢度和耐用性，以及是否符合环保标准。同时，在涂料施工时，要注意通风换气，确保安全卫生。
农村厨房完全可以设计建造成两层结构，但需要考虑以下几个因素：
1. 规划许可：在开始建设之前，应该向当地的城乡规划部门咨询相关规定，了解是否允许在农村地区建造两层厨房，以及是否需要办理相关的建设许可证。
2. 安全性：两层厨房的设计必须遵守建筑安全规范，确保结构稳固，能够承受相应的荷载，特别是上层的地板和楼板需要有足够的承重能力。
3. 功能性：两层厨房的设计应该根据实际需要合理规划空间，例如下层可作为烹饪区，而上层可用作储物或辅助烹饪空间。同时，楼梯的设计要考虑到使用的便利性和安全性。
4. 通风与排烟：由于厨房在烹饪过程中会产生大量油烟和气味，因此两层厨房的通风和排烟系统设计尤为重要，需要确保油烟能够有效排出，避免污染室内环境。
5. 水电布线：在两层厨房的设计中，水电布线也是一个需要重点考虑的问题，要确保管线布置合理、安全，并符合电气和给排水的规范要求。
6. 成本预算：两层厨房的建设成本通常比单层厨房要高，因此在决定建造两层厨房之前，应该做好充分的成本预算和资金准备。
综上所述，农村厨房可以建造成两层结构，但需要综合考虑规划许可、安全性、功能性、通风排烟、水电布线及成本预算等因素，并确保设计方案符合当地的建筑规范和标准。