玻璃奶瓶最常用的消毒方法是开水煮沸消毒，也可以使用蒸汽消毒。
在进行开水煮沸消毒时，首先需要在流动的清水下，使用干净的刷子将奶瓶从里到外刷洗干净；然后取出奶嘴及其他橡胶制品，将奶瓶放入开水中，煮沸消毒5～8分钟左右，然后再将奶嘴及其他橡胶制品放入开水中，再煮沸消毒3～5分钟左右。最后擦干使用。
蒸汽消毒是使用专门的蒸汽消毒锅或奶瓶消毒器，进行奶瓶的消毒，操作期间比较方便。在进行蒸汽消毒前，也需要将奶瓶清洗干净，然后将奶瓶中的奶嘴拆下来，将瓶身倒立放入消毒器皿，奶嘴放在特定的位置，最后盖上盖子，插上电源即可。
一般来说，需要进行每天一次的玻璃奶瓶消毒，每次喝完奶后，建议清洗一次奶瓶，可以有效得预防病菌感染或繁殖，降低宝宝感染病菌的几率。
玻璃奶瓶的抗摔能力因品牌和制造工艺而异。一般来说，采用特殊工艺技术生产的玻璃奶瓶，如加厚设计、特殊处理等，具有更好的抗摔能力。此外，一些品牌的玻璃奶瓶也经过了严格的耐热、耐冲击等测试，证明其具有较高的抗摔能力。但无论是任何类型的玻璃奶瓶，使用时都应当小心谨慎，避免摔碎。如果您担心玻璃奶瓶的抗摔能力，可以选择其他材质的奶瓶，如塑料或不锈钢奶瓶，它们具有更好的抗摔能力，也更加安全。
将奶瓶或者奶带放入支架内，选择“暖奶”功能，暖奶功能在3秒后自动启动。暖奶一般是40到45度，根据实际需求在37-50度之间调整，玻璃奶瓶暖奶一般3-5分钟就可以了，暖奶时间最长为2小时，超时奶粉，或母乳变质就不能再给宝宝食用了。注意：暖奶后的玻璃壶内水不可以引用，可用于清洁或者直接废弃。