选择益生菌时，需要考虑以下四个方面：
1. 看菌种：肠道的不同位置分布着不同的菌属，每种菌对健康都有独特的功效。多样化菌种更有利于人体构建健康微生态。也就是说配方含有多样菌种的益生菌产品更符合肠道的健康需求。
2. 看活性：益生菌只有在“活着”的时候才能发挥作用，如果失活，那么益生菌不能顺利的通过胆汁、胃酸等考验，无法在肠道内定植那么就失去作用。
3. 看数量：益生菌不仅要活着，还要达到一定的数量才能发挥作用，如果摄入益生菌数量过少，可能达不到效果。也有可能在未到达肠道前，就“牺牲”了。
4. 看配方：好的益生菌应该配料简单，没有额外的添加剂;亦或者是有针对性地添加了能与益生菌协同作用的成分，如能够帮助益生菌增殖的益生元等。
以上四个方面是选择益生菌时需要考虑的关键因素。在选择益生菌时，建议根据自身的身体状况和需求，综合考虑这四个方面的因素，选择最适合自己的益生菌产品。
1.数量
首先，要成为真正的益生菌，其产品必须含有活的和活性的细菌培养物，并且应该在包装上注明。一般建议选择具有至少10亿个菌落形成单位并含有乳酸杆菌、双歧杆菌或布拉迪酵母属的益生菌产品，这些是研究最多的益生菌。
2.活性
活的益生菌才不会产生耐药性。益生菌经人体服用后通过胆汁和胃酸，没有处理或筛选过的益生菌经过胆汁胃酸时则会死亡从而失去作用。那么这样的益生菌补充剂就算有再多的数量也无济于事。所以好的产品都会对益生菌做处理如冷冻干燥技术，包埋技术等。
3.种类
益生菌食品是摄取益生菌一个很好的选择，特别是发酵食品，如酸奶、红茶菌（发酵红茶）、酸菜（冷藏、非货架稳定）、泡菜（由发酵的卷心菜制成）、豆豉和豆豉（由发酵大豆制成）。此类食品提供了一种滋养环境，细菌繁殖并释放出一种重要的副产品，短链脂肪酸。
4.年龄
中老年人肠内益生菌减少，因此这个年龄段的人比较适合饮用酸奶，能补充肠道益生菌的不足。
选择益生菌的4条标准：
1、选择安全可靠的菌株（参考卫生部公布婴幼儿可食用菌种菌株）；
2、配料里不含奶、糖、麸质等添加物（这些都不是必需添加的，且存在过敏等风险）；
3、选择足够的活菌数（参考活菌总数、制菌技术、菌株来源）；
4、选择干燥粉末制剂（活菌数有保障、易保存）。