港澳通行证可以在自助机上办的。具体方法：
1.进入自助办证一体机系统 ,在屏幕的左上角点击 “续签”按钮,选择电子通行证续签。
2.系统提示插入电子通行证,插入电子通行证后,选择前往目的地和前往的次数,并根据页面提示,选择缴款方式。可选择“银联卡缴费”或“去银行缴费”两种方式。
3.缴费后,请认真核对好个人的申请信息,然后点击“下一步”,等待制卡,然后核对制卡信息,信息无误,取卡就可以了
港澳通行证需要15日能办下来。自受理之日起10个工作日（首次或非首次申请）办结，但均不含邮递日（一般在五天左右）以及节假日。
首次办理须本人至户籍所在地的出入境管理处提交申请，居民身份证及复印件（用A4纸复印，可复印在同一张纸上）以及填写《中国公民出入境证件申请表》进行办理。